ویتامین B12 توسط باکتریها سنتز می شود اما ویتامین تولید شده از فلور کولون جذب نمی گردد. این ویتامین در بافت های حیواناتی که نیاز به منابع غذایی ویتامین برای انجام اعمال حیاتی در تقسیم سلولی و رشد دارند یافت می شود. غنی ترین منابع ویتامین جگر، کلیه، شیر، تخم مرغ، ماهی، پنیر و گوشت های عضله است. غذاهای گیاهی فقط در صورت آلودگی یا سنتز باکتریایی حاوی ویتامین B12 هستند.

بسیاری از مردم بر این باورند که غذاهای تخمیر شده حاوی مقدار کافی ویتامین B12 برای تأمین نیازهای آنان می باشند. ولی این تئوری با آزمایشات ثابت نشده است. شش نمونه از محصول تخمیر شده لوبیای سویا آنالیز شد که مقدار ویتامین B12 آنها ناچیز بود.

در عوض بعضی سبزیجات پخته دریایی حاوی ویتامین B12 در حد جگر گاو هستند. افرادی که رژیم گیاهخواری مطلق دارند بخصوص بعد از 6-5 سال سطوح در گردش پایین ویتامین B12 را نشان می دهند مگر آنکه مکمل ویتامین را دریافت کنند.

گیاهخواران مصرف کننده شیر و تخم مرغ که منابع غذایی ویتامین B12 را در رژیم خود دارند سطوح در گردش پایین ویتامین B12 را نشان نمی دهند. حدود ۷۰٪ فعالیت ویتامین در پختن بیشتر غذاها حفظ می شود. ولی مقادیر قابل توجهی از ویتامین ممکن است در پاستوریزاسیون یا تبخیر شیر از بین برود.